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UMT Innoplant

Détecter les pathogènes dans différentes matrices grâce à des outils adaptés et performants

Extraction de nématodes libres dans des échantillons de sols
Analyse bactérienne d'échantillons d'eau par filtration
Test PCR temps réel

Il n’existe pas toujours de méthodes efficaces pour lutter contre les différents parasites (ex. : bactéries, nématodes) et la lutte repose souvent sur un ensemble de mesures préventives visant à éviter l’introduction des parasites ou leur dissémination à partir de foyers déclarés. Pour cela, il est nécessaire d’effectuer des contrôles sur le matériel végétal produit et introduit sur le territoire mais aussi sur les différents compartiments de l’environnement susceptibles d’héberger ces bio-agresseurs : eau, sol, adventices, boues, sous produits des industries,… Ce contrôle nécessite des outils de détection adaptés aux substrats testés et suffisamment sensibles.

  • Les principaux points travaillés dans cette action pour le volet végétal sont :
    • Détection du PVY sur les différents organes de la pomme de terre par l’outil  PCR temps réel;
    • Détection directe des nématodes à galles dans les plantes sans passer par une étape préalable d’isolement des individus.
  • Sur les matrices plus complexes de type effluents d’usines agroalimentaires, boues, déchets verts, la mise au point de méthodes de détection des différents parasites (bactéries, champignons, nématodes) sera conduite :
    • Soit en faisant appel aux propriétés biologiques des micro-organismes cibles (piégeage par des plantes hôtes, isolement sur milieux sélectifs,…) associées ou non à une caractérisation moléculaire,
    • Soit en développant des méthodes robustes d’extraction de l’ADN directement à partir des matrices complexes.
Extraction de nématodes par élutriation

Extraction de nématodes par élutriation

Bactéries pectinolytiques

Isolement des bactéries pectinolytiques sur le milieu semi-sélectif  CVP

illustration nématode

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site projet caliso

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Nominations au concours ITA’ innov 2017

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